近日，朱玉贤院士团队在《Plant Biotechnology Journal》（Impact factor: 6.840， 一区）发表了题为“PsORF：A database of small ORFs in plants“的论文，该研究在植物小开放阅读框（small ORF，sORF）的数据库建设上取得了重要进展，他们所建立的数据库为35个植物物种提供了完整的sORF数据集信息。该研究工作的通讯作者是王坤副研究员，第一作者是2017级硕士生陈燕君同学。
当前，动植物分子生物学研究逐渐进入深度化与精细化阶段，科学家们认识到基因组中存在大量的sORF（编码小于或等于100个氨基酸的短肽）可能通过编码功能短肽或调控mRNA翻译而参与生物个体的正常生长发育等重要过程。随着近年来植物研究中翻译组（如Ribo-seq等）和蛋白质组（质谱）等测序数据的积累，为我们通过高通量的预测方法对全基因组范围可能具有翻译能力的sORF进行鉴定提供了契机。在该项研究中，研究团队通过整合公共数据库中的基因组和转录组RNA-seq，特别是翻译组Ribo-seq和蛋白质组质谱数据对包括莱茵衣藻，拟南芥，棉花（亚洲棉），水稻和玉米在内的35个植物物种做了sORF的预测注释。并根据上述结果，构建了一个可通过Web访问的数据库PsORF（http://psorf.whu.edu.cn/）。
PsORF数据库通过多种可视化组件为用户提供了方便的浏览，查询和下载服务,并与UniProt和Pubmed等已知功能数据库建立了有效关联。通过该网站，用户可以方便的查询候选sORF的翻译证据，如Ribo-seq的测序reads和MS指纹图谱，以及可能的跨物种保守性分析，如多物种sORF的蛋白质序列比对和系统发生树。这一工作为植物sORF的后续研究提供了便捷的查询和分析平台。
该工作得到了国家转基因专项、国家自然科学基金、中央大学基础研究基金和武汉大学创新团队等项目的资助。在数据库的构建过程中，武汉大学金沙8888js官方周宇老师和杜巍老师也给予了技术和材料方面的大力支持。
